Сумеречная Искорка – прилежная ученица принцессы Селестии. Она очень ответственно подходит к каждому заданию принцессы. И каждую неделю отправляет принцессе отчет о магии дружбы, чему научилась за неделю. Но вот однажды, последний день написания отчета близился к концу, а Искорка не написала отчет. Она отправляется к каждой из подруг в надежде, что они нуждаются в ее помощи. Подруги не понимают ее паники, ведь Селестия – добрая и справедливая принцесса. Но Искорка боится что ее отзовут из Поневиля.

Три маленькие пони разбудили дух беспорядка и раздора – Дискорта. По всей Эквестрии стали твориться странные вещи – из облаков из сахарной ваты пошли молочно-шоколадные дожди, на деревьях повырастали громадные яблоки, кукурузные поля покрылись попкорном, а у зверей повырастали длинные ноги с копытами.
Тогда принцесса Селестия вызывает Сумеречную Искорку со своими подругами во дворец. Она рассказывает, что только им под силу остановить Дискорта, ведь они имеют связь с элементами гармонии, уже остановившими однажды злобного духа. И когда она собирается передать пони элементы, обнаруживается, что они пропали. Их похитил Дискорт и тогда, чтобы найти их, пони отправляются в лабиринт, который полон ловушек и испытаний.
Хитрый Дискорт разделяет подруг и пытается по одной каждую исключить из игры. В итоге все пони кроме Искорки остались под властью иллюзий и они так и не нашли элементы гармонии.

Приключения Твалайт Спаркл и ее подруг Флаттершай, Радуги Дэш, Рэрити, Пинки Пай и Эпл Джек продолжаются! И снова им предстоит спасти Эквстрию с помощью элементов Гармонии. На этот раз от против могучего духа хаоса и разрушения Дискорта, которому почти удается рассорить подруг. Но магия дружбы преодолевает все преграды. Уже не только Твалайт Спаркл пишет еженедельные отчеты принцессе Селестии, но и все ее подруги. А поучится им предстоит многому.
Во втором сезоне мы знакомимся со братом Твайлайт - Шайнинг Армером, начальником королевской стражи и его невестой принцессой Миаморе Каденс, так же с Королевой перевертышей и ее свитой. Здесь показана еще одна великая магия - магия любви, которую не удается преодолеть злой королеве и ее войску.

Сумеречная Искорка со своими подругами собирается на Бал в честь грандиозного гала концерта во дворце принцессы Селестии. У каждой из шести маленьких пони есть своя мечта, которая должна сбыться на балу. Искорка хочет провести вечер с принцессой и поговорить с ней, Пинки - устроить грандиозную вечеринку, Флаттершай подружится с животными в саду у принцессы, Эпплджек - продать яблок и заработать много денег, Радуга Дэш пообщаться с командой Чудо молнии, Рарити очаровать принца Голубая Кровь. Полные надежд они отправляются в путь и начало бала сулит им сбывание всех их желаний.

Пинки Пай приглашает подруг на вечеринку в честь дня рождения ее любимого дракончика Зубастика. Вечеринка прошла очень весело. И Пинки Пай решила повторить ее... На следующий день она пришла приглашать подруг, но у каждой из ни нашлись неотложные дела. Ничего не вызывало подозрений, пока Пинки не заметила прячущуюся Искорку. Потом ей стало казаться, что подруги ее избегают. Неужели они больше не хотят с ней общаться?

Искорка вместе со Спайком собрались на метеор шоу, которое проходит раз в сто лет. Спайк является очень хорошим помощником для Искорки. Она не нахвалится им. Подругам Искорки тоже очень нравиться маленький дракон. Но однажды Спайк так забегался помогая Искорке, что уснул. В это время Искорка знакомится с Совой и назначает ее новым помощником, для того чтобы Спайк не так уставал. Но сам дракончик решил, что его хотят заменить.

Малышка Эплблум и ее подружки решили узнать, как у других пони появились их знаки отличия. Первую они спросили Эпплджек. Она, когда была маленькая, не хотела жить на ферме, она мечтала быть столичной пони как ее тетя и дядя Оранж. Но когда она приехала к ним в гости она очень скучала по дому. Зато Эпплджек поняла, кем ей суждено быть в жизни. И как только она это поняла, у нее появился знак отличия.
Затем они встретила Флаттершай, Рарирти, Искорку и Пинки Пай. И все они рассказали, как у них появились знаки отличия. Но малышам натерпелось услышать историю Радуги Дэш...

Принцесса Селестия приехала в Поневиль на праздник и пригласила Искорку с ее подругами на праздник. Искорка давно хотела познакомить принцессу с подругами и вот представился случай. На праздничном обеде принцесса Селестия показала Флаттершай свою птицу - Филомину. Но выглядела эта птица не совсем здоровой. Поэтому когда принцессе пришлось срочно покинуть праздник, Флаттершайрешила забрать Филамину себе, чтоб подлечить. Но чем бы она не лечила ее, Филамине становилось все хуже. Тем временем птицу принцессы у же начала разыскивать стража.

Подружки пони направляются на поезде в Эпэллузу, куда везут яблоню - Блумберга. По дороге в город на поезд нападет стадо бизонов и отцепляет последний вагон вместе с Блумбергом и Спайком. Радуга и Пинки Пай находят Спайка первыми. И узнают, что бизоны вовсе не так плохи. Эти земли принадлежали им еще до переселенцев и они спокойно скакали по полям, но жители Эпэллуза засадили все деревьями, даже не спросив у коренных жителей согласия.
Эпэллузцы, в свою очередь, нажаловались пони. что бизоны не дают садить им деревья и им приходится сражаться за землю. Все попытки примирить бизонов и пони ни к чему не приводят и вот впереди решающий день. У бизонов ежегодный забег, который пролегает через яблоневый сад эпэллузцев.